Das hängt davon ab, welche Sametime Serverversion ihr einsetzt. Seit Sametime 11 gibt es einen "Persistent chat", der auf dem Server in einer Mongo DB gespeichert wird: Den kann man als User gar nicht löschen... Wenn es sich um Deinen "persönlichen" Chat handelt, dann liegt der je nach Konfiguration entweder in der Mail-Datenbank in einer speziellen Ansicht, oder im Dateisystem im von Dir konfigurierten Pfad. Dann kannst Du es dort löschen.