Was Du für "kontraproduktiv" hälst oder nicht spielt hier keine Rolle: In Lotus Notes ist es nun mal (seit Jahrzehnten) so gelöst:
Jedes Dokument hat einen Verweise auf genau sein "Elterndokument" (Technisch im Item $Ref), weiss aber nichts über seine Grosseltern oder Urgrosseltern. Wenn Du jetzt den "Papa" löschst, dann verliert das Dokument seine Verknüpfung zum Thread, und damit ist eine Zuordnung -mangels Referenzen- schlicht technisch nicht mehr möglich. Natürlich könnte IBM jetzt Ihr gesamtes System umstellen, und die IDs durchvererben, um solche Fälle abzufangen... Tun sie aber nicht.
Und jetzt bitte nicht anfangen mit "andere können das aber"... Das mag sein, aber bei IBM ist es einfach systembedingt nicht so einfach möglich und würde ein komplettes redesign der Art und Weise erfordern, wie Notes mit Antworthierarchien umgeht.