Einfache Lösung wenn der JVM Patch installiert ist:
Unter 'C:\Program Files\IBM\Lotus\Notes\jvm\bin' einen neuen, leeren Ordner 'new_plugin' erstellen und dann FP3 Installation starten.
Unter Mac OS hatte ich auch keine Probleme, hatte aber auch keinen JVM Patch dort installiert (gab es dafür ja auch garnicht, oder?). Ohne installierten JVM Patch läuft die Installation scheinbar problemlos durch.