Brauchst du die Daten aus der Names.nsf nur einmal? Sozusagen als Stammdaten in deiner MySQL? Dann könntest du dir in der Names.nsf eine Ansicht basteln und die Notes Dokumente in eine Textdatei exportieren und diese dann wiederum in deine relationale DB importieren.
Wenn die MySQL und die Notes Datenbank öfter Daten abgleichen sollen, dann geht das wie Wirsing schon sagte über ODBC.