Mir ist nicht so ganz klar, was Du meinst? Meinst Du mit "Mail-Ordner" das Verzeichnis "mail\" auf dem Domino-Server, in dem die Maildatenbanken sind?
Oder meinst Du Ordner in Deiner Maildatenbank?
Falls ersteres: So ein Verzeichnis verschwindet ja nicht von selbst. Vielleicht ist es ja ein Dirlink und einer hat die Datei "mail.dir" gelöscht.
Andreas