Dann gehen wir jetzt mal davon aus, daß Du einen eineindeutigen Schlüssel in beiden Datenquellen hast.
Mach Dir dann in der Ziel-DB eine Ansicht, die die importierten Doks sortiert nach dem eineindeutigen Schlüssel anzeigt (sind die Felder mit dem eineindeutigen Schlüssel unterschiedlichst benamst, kannst Du ja ohne weiteres als Spaltenformel sowas wie
CustomerNo + KundenNr
machen - es wird dann ja nur der jeweils in der Maske vorhandene Feldname resp. -inhalt verwendet.)
Durch diese Ansicht kannst Du nun marschieren mit verschiedenen Methoden (Vergleich, ob das NextDocument einen anderen Schlüssel aufweist als das vorige, jeweils Collections bilden ...) und dann die jeweiligen Werte auslesen und in die Ziel-Datenbank konsolidieren.
Formelsprache ist hier aussen vor.
Wenn noch was fehlt, sag' Bescheid.
Bernhard