1) Notes != Outlook
2) Outlook speichert so etwas als .EML im Filesystem ab, weil der Exchange-Server Systemtechnisch bedingt nicht mit großen Files umgehen kann und die User daher regelmäßig Mails aus dem PSD-File auslagern müssen (behaupte ich jetzt mal bösartig ;9).
3) NIEMAND bei MS garantiert Dir, dass die nächste(n) Version(en) von Outlool diese .EML Dateien auch lesen können. Hierbei handelt es sich -- wie bei MS des öfteren -- um ein proprietäres, undokumentiertes Dateiformat.
4) Anstelle des Dateisystems solltet könntest Ihr Euch überlegen, diese "wichtigen" Mails in einer Notes-Datenbank abzulegen. Damit hast Du durchsuchbarkeit, Zugriffkontrolle, etc. gleich auch mit erledigt.