Hi,
wenn du eine sebstzertifizierten SSL Key hast, dann ist es kein Problem den neuzumachen. Wenn es ein offizieller ist, dann musst du eben einen neuen Key erzeugen, und diesen bei der Zertifizeirungsstelle neu einreichen. Die Meldung wg. vorhandener keyfile.kyr ist korrekt und muss bestätigt werden, weil du ja kein aktuelles mehr hast.
Aber warum wurde das nicht gesichert? An Legato liegt das aber nicht unbedingt, habe genügend Kunden mit SSL Zertifikaten und Legato und bei denen wird alles gesichert.