1) Das Notes Datenverzeichnis auf ein Netzlaufwerk zu legen, wird von IBM in Notes 6 nicht offiziell unterstützt. Das nur so nebenbei. Roaming User macht man anders.
2) Die NTFs kann man IMHO (großteils, aber nicht alle) löschen - vor allem die großen Mail-Templates.
3) Wozu liegen in dem Verzeichnis Lotus Word Pro Dateien herum?
4) Die Cache-NDK würde ich über den INI-Parameter lokal legen, dann sollten die User auch einen Performance-Boost merken.
5) Die Dictionary-Files jener Sprachen, die Du nicht brauchst, kannst Du auch löschen.
6) IBM_TECHNOICAL_SUPPORT kannst auch löschen - wird im Zweifelsfall wieder angelegt