Zum Thema Replikation Server 1 mit Server 2. Sollten die beiden Server doch einmal miteinander replizieren, hast Du die Dokumente doppelt, denn durch das Kopieren über die Zwischenablage bekommen die eingefügten Dokumente neue DokumentIDs und haben - außer dem logisch gleichen Inhalt - nichts mit den kopierten Dokumenten gemeinsam. Als temporäre Lösung, weil die Datenbanken aus irgendwelchen technischen Gründen vorübergehend nicht replizieren, kannst Du das Kopieren nicht nutzen.
Wenn die Datenbanken nicht miteinander replizieren dürfen, würde ich die als eigene Kopien anlegen, und nicht als Replik. Replizieren die Server später unerwartet doch, ist das Chaos perfekt.