Seit der Version 8 startet der Domino Server den Cluster automatisch nach so weit ich weiß, denn man benötigt die Task nicht mehr als Programmdokument oder in der Notes.Ini damit diese bei einem Clustermember gestartet wird.
Warum deaktivierst du die Datenbank nicht in der cldbdir.nsf (Cluster Directory) für die Cluster Replikation ? Falls zudem noch ein Replikationsdokument für alle Datenbanken zwischen den 2 Clusterservern existieren sollte würde ich auf dem zweiten Server zur Sicherheit in den Replikations-Eigenschaften auch die Replikation temporär deaktivieren
Viele Grüße
Christian