Mit XPages spielt Domino wieder im Spiel der "world class web application server" mit, hat aber weiterhin alle Vorteile der Notes Technik (Replikation, Volltextsuche, Security, Messaging, Calendaring.....).
Mit XPages kann man vorhandene Notes-Apps mit allen modernen Web 2.0 bells & whistles als Web App weiterentwickeln.
Websphere ist auch ein Web Application Server mit dem man viele coole Sachen machen kann. Ist aber in der Tat was völlig anderes als Domino; die ganzen grundlegenden Domino Bausteine sind dort halt nicht vorhanden.
Wie immer: es kommt auf den Anwendungszweck an. Ich empfehle, nicht erstmal was über die Produkte zu lernen und sich dann den Anwendungszweck zu überlegen sondern erst die Anforderungen definieren, dann zur Produktauswahl kommen.