Ja, kannst Du. Die Internet-Domäne hat nichts mit der Notes-Domäne zu tun.
Du mußt dann deinem Domino-SMTP beibringen, daß er die Domäne auch annimmt (im Konfigurationsdokument und in der globalen Domäne).
Das größere Problem ist das Versenden, zumindest wenn Benutzer unter beiden Domänen versenden sollen. In dem Fall wirst Du vermutlich mit unterschiedlichen Arbeitsumgebungen arbeiten müssen.
Angaben ohne Gewähr, bin nur Laien-Admin