Ich meine auch archive style logging. Um genau zu sein, werden die transactional logfiles vom domdsmc auf inaktiv gesetzt. Der Domino Server macht dann, wenn er es für richtig hält, etwas mit den inaktiven logfiles. Das kann auch überschreiben sein. (Zumindest bilde ich mir ein, das beobachtet zu haben.) Beim Herunterfahren löscht er die inaktiven Logs für gewöhnlich.
Willst Du die Logfiles selbst über das Filesystem löschen?
Warum? Geht Dir dieses FS über?