Gut, der Serverabsturz würde erklären, warum manche DBen nicht komprimiert werden. Steht denn im Logfile nicht drinnen welche die letzte DB war, die er komprimierte, bevor er abstürzt? Du könntest auch einmal abends manuell die einzelnen Verzeichnisse komprimieren, damit du den Fehler eingrenzen kannst, möglicherweise eine korrupte Datenbank oder ein enthaltenes Attachement.