Hängt von den Einstellungen ab. Theoretisch könnte es sein, daß Mails aus bestimmten Ordnern oder Mails, die älter als X Tage sind in eine Archiv-Datenbank verschoben werden oder sogar gelöscht werden.
Ihr solltet dann vor allem schauen, ob auf dem Server ein compact mit Parameter -A, -a oder -j auf die Datenbanken läuft.